אם עד לפני זמן מה, רוב מאמצי מחמל"י התמקדו בניסיונות אישוש וסיוע ליונקים ימיים במצוקה, הרי שהיום מבינים בעמותה את החשיבות שבפעולות החינוך למניעת פגיעה בסביבת המחיה של היונקים הימיים ולקידום ההגנה עליהם ועל שימורם.
בשנים האחרונות משקיעה מחמל"י משאבים בפיתוח תוכניות חינוכיות העוסקות בשימור יונקים ימיים ובהגנה עליהם, על ידי הקניית ידע, פיתוח מודעות והטמעה באמצעות חוויה מעשירה ומשמעותית. יש לזכור, שמאחר שתחום מחקר היונקים הימיים בישראל מאוד מצומצם ומאתגר, כל יציאה לסקר בים היא בבחינת אירוע חינוכי לכל דבר, שבמסגרתו מתנדבי העמותה זוכים ללמוד רבות על הים ודייריו ועל חשיבות הסביבה הימית עבור האנושות כולה.
